Při provozu naftového motoru nelze nikdy zcela zamezit průniku paliva do motorového oleje, neboť se nikdy nedosáhne absolutního utěsnění. Navíc při studeném startu motor nespaluje vše a část rostlinného oleje steče ve formě olejového filmu po stěně válce a dostane se do olejové vany kde se smíchá s motorovým olejem. Rostlinný olej má lepivý účinek který přitahuje nečistoty a uvolňuje usazenou špínu a kovové částice. Tím může vytvářet žmolky, které mohou ucpat okruh motorového oleje, jako například mazací skulinu na kluzném ložisku, apod.

Z tohoto důvodu je velmi důležité, pokud nechceme snížit životnost motoru, aby se co nejdříve po přestavbě na provoz na rostlinný olej provedla výměna motorového oleje. I později během provozu vozidla na rostlinný olej by měla být výměna oleje prováděna častěji, než při provozu na naftu. Některé profesionální firmy zabývající se přestavbami doporučují preventivně dokonce zkrácení intervalu výměny oleje až na polovinu. Toto však není ani ekonomické, ani ekologické a provoz se tím prodražuje. Většina firem zabývající se přestavbou proto doporučuje jako doplněk namontovat zároveň obtokovou mikrofitrační jednotku motorového oleje (Nebenstrommotorölfilter, Feinstfilter, bypass filter).